Del código al genoma

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####Dra. Evelia Coss 
#### 27/febrero/2026
]

.left[.footnote[R-Ladies Theme[R-Ladies Theme](https://www.apreshill.com/project/rladies-xaringan/)]]

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# Sobre mi
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### <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 448 512" style="height:1em;width:0.88em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:#181818;overflow:visible;position:relative;"><path d="M416 0c17.7 0 32 14.3 32 32c0 59.8-30.3 107.5-69.4 146.6c-28 28-62.5 53.5-97.3 77.4l-2.5 1.7c-11.9 8.1-23.8 16.1-35.5 23.9l0 0 0 0 0 0-1.6 1c-6 4-11.9 7.9-17.8 11.9c-20.9 14-40.8 27.7-59.3 41.5H283.3c-9.8-7.4-20.1-14.7-30.7-22.1l7-4.7 3-2c15.1-10.1 30.9-20.6 46.7-31.6c25 18.1 48.9 37.3 69.4 57.7C417.7 372.5 448 420.2 448 480c0 17.7-14.3 32-32 32s-32-14.3-32-32H64c0 17.7-14.3 32-32 32s-32-14.3-32-32c0-59.8 30.3-107.5 69.4-146.6c28-28 62.5-53.5 97.3-77.4c-34.8-23.9-69.3-49.3-97.3-77.4C30.3 139.5 0 91.8 0 32C0 14.3 14.3 0 32 0S64 14.3 64 32H384c0-17.7 14.3-32 32-32zM338.6 384H109.4c-10.1 10.6-18.6 21.3-25.5 32H364.1c-6.8-10.7-15.3-21.4-25.5-32zM109.4 128H338.6c10.1-10.7 18.6-21.3 25.5-32H83.9c6.8 10.7 15.3 21.3 25.5 32zm55.4 48c18.4 13.8 38.4 27.5 59.3 41.5c20.9-14 40.8-27.7 59.3-41.5H164.7z"/></svg> Dra. Evelia Lorena Coss-Navarrete

Investigadora Posdoctoral en el Laboratorio Internacional de Investigación sobre el Genoma Humano [(LIIGH), UNAM](https://twitter.com/LIIGH_UNAM), campus Juriquilla

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 640 512" style="height:1em;width:1.25em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M579.8 267.7c56.5-56.5 56.5-148 0-204.5c-50-50-128.8-56.5-186.3-15.4l-1.6 1.1c-14.4 10.3-17.7 30.3-7.4 44.6s30.3 17.7 44.6 7.4l1.6-1.1c32.1-22.9 76-19.3 103.8 8.6c31.5 31.5 31.5 82.5 0 114L422.3 334.8c-31.5 31.5-82.5 31.5-114 0c-27.9-27.9-31.5-71.8-8.6-103.8l1.1-1.6c10.3-14.4 6.9-34.4-7.4-44.6s-34.4-6.9-44.6 7.4l-1.1 1.6C206.5 251.2 213 330 263 380c56.5 56.5 148 56.5 204.5 0L579.8 267.7zM60.2 244.3c-56.5 56.5-56.5 148 0 204.5c50 50 128.8 56.5 186.3 15.4l1.6-1.1c14.4-10.3 17.7-30.3 7.4-44.6s-30.3-17.7-44.6-7.4l-1.6 1.1c-32.1 22.9-76 19.3-103.8-8.6C74 372 74 321 105.5 289.5L217.7 177.2c31.5-31.5 82.5-31.5 114 0c27.9 27.9 31.5 71.8 8.6 103.9l-1.1 1.6c-10.3 14.4-6.9 34.4 7.4 44.6s34.4 6.9 44.6-7.4l1.1-1.6C433.5 260.8 427 182 377 132c-56.5-56.5-148-56.5-204.5 0L60.2 244.3z"/></svg> Dr. Federico Sánchez Quinto](https://scholar.google.com/citations?user=eCs-tmMAAAAJ&hl=es)

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:1em;width:0.97em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg> EveliaCoss.github.io](https://eveliacoss.github.io/)

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;width:1em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M64 112c-8.8 0-16 7.2-16 16v22.1L220.5 291.7c20.7 17 50.4 17 71.1 0L464 150.1V128c0-8.8-7.2-16-16-16H64zM48 212.2V384c0 8.8 7.2 16 16 16H448c8.8 0 16-7.2 16-16V212.2L322 328.8c-38.4 31.5-93.7 31.5-132 0L48 212.2zM0 128C0 92.7 28.7 64 64 64H448c35.3 0 64 28.7 64 64V384c0 35.3-28.7 64-64 64H64c-35.3 0-64-28.7-64-64V128z"/></svg> ecoss@liigh.unam.mx](mailto:ecoss@liigh.unam.mx)
    
]

### <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 576 512" style="height:1em;width:1.12em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:#181818;overflow:visible;position:relative;"><path d="M287.9 0c9.2 0 17.6 5.2 21.6 13.5l68.6 141.3 153.2 22.6c9 1.3 16.5 7.6 19.3 16.3s.5 18.1-5.9 24.5L433.6 328.4l26.2 155.6c1.5 9-2.2 18.1-9.7 23.5s-17.3 6-25.3 1.7l-137-73.2L151 509.1c-8.1 4.3-17.9 3.7-25.3-1.7s-11.2-14.5-9.7-23.5l26.2-155.6L31.1 218.2c-6.5-6.4-8.7-15.9-5.9-24.5s10.3-14.9 19.3-16.3l153.2-22.6L266.3 13.5C270.4 5.2 278.7 0 287.9 0zm0 79L235.4 187.2c-3.5 7.1-10.2 12.1-18.1 13.3L99 217.9 184.9 303c5.5 5.5 8.1 13.3 6.8 21L171.4 443.7l105.2-56.2c7.1-3.8 15.6-3.8 22.6 0l105.2 56.2L384.2 324.1c-1.3-7.7 1.2-15.5 6.8-21l85.9-85.1L358.6 200.5c-7.8-1.2-14.6-6.1-18.1-13.3L287.9 79z"/></svg> Miembro

- [Rladies Morelia](https://www.facebook.com/profile.php?id=100093337606435)
- [CDSB - Mexico](https://twitter.com/CDSBMexico)
- [RIABIO](https://twitter.com/RiaBioNet)
- [The Carpentries](https://carpentries.org/index.html)
- [ISCB-RSG Mexico](https://rsg-mexico.iscbsc.org/)
- [ISCB Wikipedia team](https://x.com/iscbwikiteam)
]

### <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;width:1em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:#181818;overflow:visible;position:relative;"><path d="M418.4 157.9c35.3-8.3 61.6-40 61.6-77.9c0-44.2-35.8-80-80-80c-43.4 0-78.7 34.5-80 77.5L136.2 151.1C121.7 136.8 101.9 128 80 128c-44.2 0-80 35.8-80 80s35.8 80 80 80c12.2 0 23.8-2.7 34.1-7.6L259.7 407.8c-2.4 7.6-3.7 15.8-3.7 24.2c0 44.2 35.8 80 80 80s80-35.8 80-80c0-27.7-14-52.1-35.4-66.4l37.8-207.7zM156.3 232.2c2.2-6.9 3.5-14.2 3.7-21.7l183.8-73.5c3.6 3.5 7.4 6.7 11.6 9.5L317.6 354.1c-5.5 1.3-10.8 3.1-15.8 5.5L156.3 232.2z"/></svg> Formación académica

- Doctorado en Biotecnología de Plantas, [Cinvestav, Langebio](https://twitter.com/uga_langebio),  [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 640 512" style="height:1em;width:1.25em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M579.8 267.7c56.5-56.5 56.5-148 0-204.5c-50-50-128.8-56.5-186.3-15.4l-1.6 1.1c-14.4 10.3-17.7 30.3-7.4 44.6s30.3 17.7 44.6 7.4l1.6-1.1c32.1-22.9 76-19.3 103.8 8.6c31.5 31.5 31.5 82.5 0 114L422.3 334.8c-31.5 31.5-82.5 31.5-114 0c-27.9-27.9-31.5-71.8-8.6-103.8l1.1-1.6c10.3-14.4 6.9-34.4-7.4-44.6s-34.4-6.9-44.6 7.4l-1.1 1.6C206.5 251.2 213 330 263 380c56.5 56.5 148 56.5 204.5 0L579.8 267.7zM60.2 244.3c-56.5 56.5-56.5 148 0 204.5c50 50 128.8 56.5 186.3 15.4l1.6-1.1c14.4-10.3 17.7-30.3 7.4-44.6s-30.3-17.7-44.6-7.4l-1.6 1.1c-32.1 22.9-76 19.3-103.8-8.6C74 372 74 321 105.5 289.5L217.7 177.2c31.5-31.5 82.5-31.5 114 0c27.9 27.9 31.5 71.8 8.6 103.9l-1.1 1.6c-10.3 14.4-6.9 34.4 7.4 44.6s34.4 6.9 44.6-7.4l1.1-1.6C433.5 260.8 427 182 377 132c-56.5-56.5-148-56.5-204.5 0L60.2 244.3z"/></svg> Dra Selene Fernandez-Valverde](https://twitter.com/SelFdz)
- Maestría en Biotecnología de Plantas, [Cinvestav, Unidad Irapuato](https://twitter.com/CinvestavIra)
- Ing. en Biotecnología, [UPSIN](https://www.facebook.com/UPSINSINALOA)

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## Laboratorio Internacional de Investigación sobre el Genoma Humano (LIIGH) UNAM | **LIIGH-UNAM**

- **Áreas de estudio:** genómica estructural y evolutiva, regulación génica, genética de poblaciones y ADN antiguo, biología del cáncer, y neurociencias cognitivas.

- **Modelos biológicos:** circuitos de regulación génica, poblaciones humanas y organismos modelo, sistemas celulares y tumorales.

<img src="data:image/png;base64,#figures/liigh.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

<img src="data:image/png;base64,#figures/ubicacion_liigh.png" width="60%" style="display: block; margin: auto;" />
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## Huesos de **mamuts** bajo un aeropuerto Internacional Felipe Ángeles (AIFA) en Santa Lucía, México

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## Bioinformática se conforma de la computación, biológica, matemáticas y estadística

La bioinformática, en relación con la **genética y la genómica, es una subdisciplina científica** que implica el uso de **ciencias informáticas** para *recopilar, almacenar, analizar, diseminar datos biológicos,* como secuencias de DNA, RNA y aminoácidos o anotaciones sobre esas secuencias ([NIH, 2023](https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Bioinformatica)) .

Uno de sus objetivos es: **Aumentar el entendimiento de la salud y la enfermedad, en ciertos casos, se usan para proveer mejor atención médica** ([NIH, 2023](https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Bioinformatica)).

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## La bioinformática dentro de la genómica 👾

1) **Calidad de los datos**. Paso **FUNDAMENTAL**. Incluye la manipulación y limpieza de los datos.

2) **Análisis estadístico**

> EJEMPLO: Significancia estadística, relevancia biológica, modelos estadísticos acorde al problema.

3) **Generar interpretaciones de los experimentos**. Conocer el método empleado y los archivos de salida.

> EJEMPLOS: Con los datos de RNA-Seq estaremos analizando expresión de los genes. Con datos de GWAS estaremos buscando variantes genéticas.

4) **Bioinformática predictiva**

> EJEMPLO: Predicciones de funciones, elementos genómicos, redes de co-expresión, etc.

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.left[.footnote[.black[
Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html)
]]]

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## Organizaciones gratuitas de difusión

<img src="data:image/png;base64,#figures/bioinfo3.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

.pull-right[
- [**ISCB-RSG-México**](https://rsg-mexico.iscbsc.org/): Grupo estudiantil, cursos gratuitos y journal club. 
- [**The Carpentries**](https://carpentries.org/): Cursos gratuitos y capacitaciones de instructores.
- [**ISCB Wikipedia - más allá del inglés**](https://en.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:WikiProject_Molecular_Biology/Computational_Biology/14th_ISCB_Wikipedia_competition_entries): Mejorar la calidad y cantidad de información disponible en Wikipedia.
- [**R-Ladies Morelia**](https://www.facebook.com/p/R-Ladies-Morelia-100093337606435/): Cursos gratuitos para promover la participación de mujeres y personas de géneros subrepresentados. 
- [**El MUMAT**](https://mumat.matcuer.unam.mx/): Museo Virtual de Matemáticas.
]

.left[.footnote[.black[
Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html)
]]]

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## Regional Student Group - México | **ISCB-RSG-México**

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**Consejo de Estudiantes** de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) conceptualizó los **'Grupos Regionales de Estudiantes (RSG)'**.

- **Objetivo**: promover la interacción entre los estudiantes que realizan investigaciones en el campo de la Bioinformática y la Biología Computacional.

- **Nuestra Misión** es promover el desarrollo de estudiantes de las áreas de ciencias químico-biológicas y físico-matemáticas, como la futura generación de Bioinformáticos y Biólogos Computacionales en México.
]

.center[
[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:2em;width:2em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M512 256C512 114.6 397.4 0 256 0S0 114.6 0 256C0 376 82.7 476.8 194.2 504.5V334.2H141.4V256h52.8V222.3c0-87.1 39.4-127.5 125-127.5c16.2 0 44.2 3.2 55.7 6.4V172c-6-.6-16.5-1-29.6-1c-42 0-58.2 15.9-58.2 57.2V256h83.6l-14.4 78.2H287V510.1C413.8 494.8 512 386.9 512 256h0z"/></svg>](https://www.facebook.com/rsgmexico/?locale=es_LA) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:2em;width:2em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M64 112c-8.8 0-16 7.2-16 16v22.1L220.5 291.7c20.7 17 50.4 17 71.1 0L464 150.1V128c0-8.8-7.2-16-16-16H64zM48 212.2V384c0 8.8 7.2 16 16 16H448c8.8 0 16-7.2 16-16V212.2L322 328.8c-38.4 31.5-93.7 31.5-132 0L48 212.2zM0 128C0 92.7 28.7 64 64 64H448c35.3 0 64 28.7 64 64V384c0 35.3-28.7 64-64 64H64c-35.3 0-64-28.7-64-64V128z"/></svg>](rsg-mexico@googlegroups.com) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 448 512" style="height:2em;width:1.75em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M224.1 141c-63.6 0-114.9 51.3-114.9 114.9s51.3 114.9 114.9 114.9S339 319.5 339 255.9 287.7 141 224.1 141zm0 189.6c-41.1 0-74.7-33.5-74.7-74.7s33.5-74.7 74.7-74.7 74.7 33.5 74.7 74.7-33.6 74.7-74.7 74.7zm146.4-194.3c0 14.9-12 26.8-26.8 26.8-14.9 0-26.8-12-26.8-26.8s12-26.8 26.8-26.8 26.8 12 26.8 26.8zm76.1 27.2c-1.7-35.9-9.9-67.7-36.2-93.9-26.2-26.2-58-34.4-93.9-36.2-37-2.1-147.9-2.1-184.9 0-35.8 1.7-67.6 9.9-93.9 36.1s-34.4 58-36.2 93.9c-2.1 37-2.1 147.9 0 184.9 1.7 35.9 9.9 67.7 36.2 93.9s58 34.4 93.9 36.2c37 2.1 147.9 2.1 184.9 0 35.9-1.7 67.7-9.9 93.9-36.2 26.2-26.2 34.4-58 36.2-93.9 2.1-37 2.1-147.8 0-184.8zM398.8 388c-7.8 19.6-22.9 34.7-42.6 42.6-29.5 11.7-99.5 9-132.1 9s-102.7 2.6-132.1-9c-19.6-7.8-34.7-22.9-42.6-42.6-11.7-29.5-9-99.5-9-132.1s-2.6-102.7 9-132.1c7.8-19.6 22.9-34.7 42.6-42.6 29.5-11.7 99.5-9 132.1-9s102.7-2.6 132.1 9c19.6 7.8 34.7 22.9 42.6 42.6 11.7 29.5 9 99.5 9 132.1s2.7 102.7-9 132.1z"/></svg>](https://www.instagram.com/rsg_mexico/)
]

]

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## ISCB Wikipedia - más allá del inglés

Mejorar la **cobertura y calidad en Wikipedia** de cualquier tema relacionado con las competencias básicas en bioinformática.

.pull-left[
- **Misión** promover la comprensión científica de los sistemas vivos a través de la computación es comunicar este conocimiento al público en general. 
 
Premios:

- **1.er premio:** 500 dólares estadounidenses y 1 año de membresía en la ISCB.
- **2.º premio:** 250 dólares estadounidenses y 1 año de membresía en la ISCB.
- **3.er premio:** 150 dólares estadounidenses y 1 año de membresía en la ISCB.

Convocatoria: [ISCB’s 13th Annual Wikipedia Competition!](https://www.iscb.org/about-iscb/society-communications/announcements/april-15-2024-iscb-s-13th-annual-wikipedia-competition)
]

<img src="data:image/png;base64,#figures/iscb_wikipedia.jpg" width="50%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## The Carpentries

.pull-left[
Organización sin fines de lucro dedicada a enseñar habilidades fundamentales de **programación y ciencia de datos a investigadores de todo el mundo**.

- **Misión** es democratizar el acceso a estas competencias mediante *talleres prácticos, colaborativos y de bajo costo (en su mayoria GRATUITOS)*, que se imparten en universidades, centros de investigación y comunidades científicas.

Programas principales:

1. **Software Carpentry:** básicos de programación, control de versiones y automatización de tareas.

2. **Data Carpentry:** manejo, limpieza y análisis de datos en distintos formatos y disciplinas.

3. **Library Carpentry:** gestión de datos y herramientas digitales.

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/carpentries-logo.svg" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
<img src="data:image/png;base64,#figures/rsg.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />

.center[
[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 640 512" style="height:2em;width:2.5em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M96 64c0-17.7 14.3-32 32-32H448h64c70.7 0 128 57.3 128 128s-57.3 128-128 128H480c0 53-43 96-96 96H192c-53 0-96-43-96-96V64zM480 224h32c35.3 0 64-28.7 64-64s-28.7-64-64-64H480V224zM32 416H544c17.7 0 32 14.3 32 32s-14.3 32-32 32H32c-17.7 0-32-14.3-32-32s14.3-32 32-32z"/></svg>](https://carpentries.org/)
]

]

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## R-Ladies México

.pull-left[
- Organización global que busca **promover la diversidad de género** en la comunidad del lenguaje de **programación R**.

- Red internacional de aprendizaje y colaboración en torno a R, con un fuerte enfoque en **equidad, inclusión y visibilidad de mujeres en ciencia de datos**.

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/Capitulos_rladiesMexico.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />

]

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## Museo Virtual de Matemáticas | **MuMaT**

.pull-left[
- Proyecto interactivo de la UNAM que busca acercar las **matemáticas al público de manera lúdica y visual**.

- Se organiza en 5 salas temáticas (La Cocina, La Cabina, El Tiempo, El Hormiguero y El Airemar), cada una con aplicaciones interactivas.

- Permite explorar conceptos matemáticos mediante **juegos, simulaciones y visualizaciones dinámicas**.

- Tres personajes (“Mayor”, “Minor” y “Gato”) guían al visitante con diferentes perspectivas sobre las matemáticas.

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 640 512" style="height:2em;width:2.5em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M96 64c0-17.7 14.3-32 32-32H448h64c70.7 0 128 57.3 128 128s-57.3 128-128 128H480c0 53-43 96-96 96H192c-53 0-96-43-96-96V64zM480 224h32c35.3 0 64-28.7 64-64s-28.7-64-64-64H480V224zM32 416H544c17.7 0 32 14.3 32 32s-14.3 32-32 32H32c-17.7 0-32-14.3-32-32s14.3-32 32-32z"/></svg>](https://mumat.matcuer.unam.mx/)

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/Mumat.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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background-image: url(data:image/png;base64,#figures/liigh_unam_logo.png) 
background-position: 10% 10%
background-size: 10%
class: middle, center

# VieRnes de Bioinformática en el LIIGH
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**Objetivo**: Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de *cursos gratuitos* para toda la *comunidad interesada*.

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

.pull-left[
- Fundado en septiembre 2023
- Organizadores: Dra. Evelia Coss y Dr. Israel Aguilar
- STAFF: Jorge Suazo
- **Impacto internacional** con participantes de países como: Argentina, Bolivia, Chile, Colombia, Costa Rica, El Salvador, Ecuador, Perú, Venezuela, Guatemala, España y Estados Unidos.

Redes sociales:

- Página web: https://viernesbioinformatica.github.io/

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:2em;width:1.94em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg>](https://github.com/VieRnesBioinformatica) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 576 512" style="height:2em;width:2.25em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M549.655 124.083c-6.281-23.65-24.787-42.276-48.284-48.597C458.781 64 288 64 288 64S117.22 64 74.629 75.486c-23.497 6.322-42.003 24.947-48.284 48.597-11.412 42.867-11.412 132.305-11.412 132.305s0 89.438 11.412 132.305c6.281 23.65 24.787 41.5 48.284 47.821C117.22 448 288 448 288 448s170.78 0 213.371-11.486c23.497-6.321 42.003-24.171 48.284-47.821 11.412-42.867 11.412-132.305 11.412-132.305s0-89.438-11.412-132.305zm-317.51 213.508V175.185l142.739 81.205-142.739 81.201z"/></svg>](https://www.youtube.com/@viernesdebioinfoliigh)

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

- VieRnes de Bioinformática [Parte 0](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2023) - (22 sep - 9 dic, 2023) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 1](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024) - (2 feb - 2 de agosto, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 2](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024_parte2) - (7 sep - 6 de dic, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 3](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte3) - (7 feb - 6 de junio, 2025) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 4](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4) - (5 sep - 9 de dic, 2025) 
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

## Temas

.pull-left[
- Introducción a **R, Python y Bash**
- Manipulación de datos (vector, dataframe, matriz)
- El ABC de las **funciones y loops**
- Introducción a **Quarto y Rmarkdown**
- Visualizaciones graficas con **ggplot2**
- **Git + Github**
- **Bioestadistica**
- **Buenas practicas** en bioinformática
- Preparación de data para **GWAS**
- **PCA** en Transcriptómica
- Predicción **miRNAs**
- EcoNiches
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/allison-horst-code-kitchen.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

## Workshops

.pull-left[
- Workshop. Análisis de datos de **RNA-Seq** (parte 0)
- Nexflow (parte 1)
- Bases para la inferencia **filogenética**, construcción, lectura e interpretación de árboles filogenéticos (parte 2)
- Mini curso de **metagenómica** (parte 3)
- Llamado de **variantes genéticas** (parte 3)
- **Leaving Academia** - Mi camino profesional tras dejar la academia (parte 4)
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/rmarkdown_wizards.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

# Conexión con la comunidad

**Objetivo:** aprender juntos, crecer aplicando lo que saben y fomentar proyectos colaborativos.

Crear un espacio de encuentro entre:

- Personas con datos por analizar
- Estudiantes de bioinformática

🙋 **Investigadores, postdocs y estudiantes de posgrado:**

- Si necesitas apoyo en análisis de datos
- Y estás dispuesto a otorgar crédito o coautoría en artículos

✋ **Estudiantes con experiencia en bioinformática:**

- Únete para aplicar tus conocimientos y colaborar en proyectos reales

.center[
.content-box-blue[
📥 Si quieres sumarte a esta iniciativa, contáctanos en: 👉 **ecossnav@gmail.com**
]]

---

## Proyectos de la Comunidad

.pull-left[
- **Dr. Jose Luis Tellez** - *C. elegans* como modelo de estudio de enfermedades raras y resistencia a antiparasitarios
- **Dr. Diego Cortes** - Reducción del cromosoma Y | Tortugas, lagartijas 
- **Dr. Claudia Gonzaga** - Enfermedades raras | Variantes estructurales
- **Dr. Federico Sánchez** - Explorando la historia evolutiva y la genética poblacional en México a través de datos paleogenómicos
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/debugging.jpg" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM (Parte 4)

- 5 sep - 9 de dic, 2025
- Obtuvimos más de 317 soliictudes distribuidos en: **66.6% México, 14.2% Perú, 10.1% Colombia, 5% Ecuador, 1.6% Bolivia, 0.6% Argentina, 0.3%. Uruguay, Chile, Venezuela, Guatemala, España, Estados Unidos, Italia, Brasil, Nicaragua,** y **El Salvador**.

.pull-left[
- Rango de edad: **18 a 64 años**
- 10% de los registros corresponden a **profesores investigadores**, 19.9%
estudiantes de **doctorado**, 19.2% **maestría**, 21.1% **licenciatura**.
- Alcanzamos a **166 personas** a través de *Youtube y Google meet*.

]

]

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---

## STAFF: VieRnes de Bioinformática en el LIIGH

<div style="display:flex; justify-content:center; align-items:center;">
  <div style="display:flex; justify-content:space-around; width:80%; text-align:center;">
    <div>
      <img src="figures/EveCoss.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Evelia Coss</b><br>
      Coordinadora<br>Instructora
    </div>
    <div>
      <img src="figures/IsraelAguilar.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Israel Aguilar</b><br>
      Coordinador<br>Instructor
    </div>
    <div>
      <img src="figures/JorgeSuazo.jpeg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Jorge Suazo</b><br>
      Desarrollo web<br>Instructor
    </div>
    <div>
      <img src="figures/DanielaRobles.png" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Daniela Robles</b><br>
      Coordinadora<br>LIIGH
    </div>
  </div>
</div>

---

## VieRnes de Bioinformática (Parte 5)

- Introducción a **R**
- Manipulación de datos (vector y dataframe)
- El ABC de las **funciones**
- Documentación con roxygen
- stringr
- Introducción a **Quarto** (paginas web)
- Crear presentaciones con **Rmarkdown**
- **Estadística** para datos biológicos
- Visualizaciones graficas con **ggplot2** y **ComplexHeatmap**
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ggplot2_masterpiece.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

## Workshops

.pull-left[
- **Workshop. Predicción estructural de proteínas**
  + *Fechas*: 28 y 30 de abril; 5 y 7 de mayo (martes y jueves)
  + *Duración*: 4 horas por sesión
  + *Modalidad*: híbrida (15 personas presencial / 25 virtuales)
  + *Incluye*: coffee break y comida
  + *Lugar*: LIIGH-UNAM

- **The Carpentries: Git + Bash + R/python**

+ *Fechas*: 3 días
  + *Modalidad*: Presencial
  + *Lugar*: LIIGH-UNAM

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/horst_rstudio_air.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---

.center[
.content-box-blue[
Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. 
Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**.
]]

**STAFF**

- Dra. Evelia Coss
- Dr. Israel Aguilar
- Jorge Alfredo Suazo

**Coordinación del LIIGH**

- Dra. Daniela Robles 
- Dr. Federico Sánchez
- Dra. María C. Ávila Arcos 
- Eglee Lomelin 
- Luis Aguilar
- Jair Santiago García

]

.center-col[
**Instructores**
- Sofia Salazar
- Dr. Domingo Martínez
- Dr. Obed Ramirez
- Dr. Shaday Guerrero
- Dra. Haydeé Peruyero 
- Dra. Joselyn Chávez 
- Oscar Aldana
- Alejandra Schafer
- Jazmín López Chacón
- Quetzally Medina
- Jorge Alfredo Suazo 
- Maria Fernanda Miron Toruno 
- Dra. Aline Pingarroni 
- Sofía Zorrilla Azcué
]

.right-col[
- Maria Jose Palma Martinez
- Johana Galguera
- Dr. David Valle García
- Angélica de Luna García
- Brenda Eloisa Sanchez Pichardo
- María Guadalupe Segovia Ramírez
- Alejandra Paulina Pérez González
- Josué Guzmán Linares
- Andrea Maria Torres Iribe
- Karla Guzmán Barrenechea
- Dr. Alan Michael Torres Calderon
- Armando Sunny
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