class: title-slide, middle, center background-image: url(data:image/png;base64,#imagenes/liigh_unam_logo.png) background-position: 10% 10% background-size: 15% .center-column[ # Generación de diversos gráficos usando ggplot2 ### VieRnes de Bioinformatica ####Sofía Salazar #### 2024/03/22 ] --- background-image: url(data:image/png;base64,#imagenes/liigh_unam_logo.png) background-position: 10% 10% background-size: 10% class: middle, center # VieRnes de Bioinformática ---- .left-col[ ### <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 448 512" style="height:1em;width:0.88em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:#181818;overflow:visible;position:relative;"><path d="M416 0c17.7 0 32 14.3 32 32c0 59.8-30.3 107.5-69.4 146.6c-28 28-62.5 53.5-97.3 77.4l-2.5 1.7c-11.9 8.1-23.8 16.1-35.5 23.9l0 0 0 0 0 0-1.6 1c-6 4-11.9 7.9-17.8 11.9c-20.9 14-40.8 27.7-59.3 41.5H283.3c-9.8-7.4-20.1-14.7-30.7-22.1l7-4.7 3-2c15.1-10.1 30.9-20.6 46.7-31.6c25 18.1 48.9 37.3 69.4 57.7C417.7 372.5 448 420.2 448 480c0 17.7-14.3 32-32 32s-32-14.3-32-32H64c0 17.7-14.3 32-32 32s-32-14.3-32-32c0-59.8 30.3-107.5 69.4-146.6c28-28 62.5-53.5 97.3-77.4c-34.8-23.9-69.3-49.3-97.3-77.4C30.3 139.5 0 91.8 0 32C0 14.3 14.3 0 32 0S64 14.3 64 32H384c0-17.7 14.3-32 32-32zM338.6 384H109.4c-10.1 10.6-18.6 21.3-25.5 32H364.1c-6.8-10.7-15.3-21.4-25.5-32zM109.4 128H338.6c10.1-10.7 18.6-21.3 25.5-32H83.9c6.8 10.7 15.3 21.3 25.5 32zm55.4 48c18.4 13.8 38.4 27.5 59.3 41.5c20.9-14 40.8-27.7 59.3-41.5H164.7z"/></svg> Sofía Salazar Magaña Estudiante de la [Licenciatura en Ciencias Genómicas](https://www.enesjuriquilla.unam.mx/?page_id=2136) @ ENES-J UNAM Asistente de investigación @ [RegGenoLab](https://liigh.unam.mx/), LIIGH UNAM Asistente de investigación @ [Im Lab](https://hakyimlab.org/), The University of Chicago [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:1em;width:0.97em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg> GitHub: SophSM](https://github.com/SophSM) ] .center-col[ ### <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 576 512" style="height:1em;width:1.12em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:#181818;overflow:visible;position:relative;"><path d="M287.9 0c9.2 0 17.6 5.2 21.6 13.5l68.6 141.3 153.2 22.6c9 1.3 16.5 7.6 19.3 16.3s.5 18.1-5.9 24.5L433.6 328.4l26.2 155.6c1.5 9-2.2 18.1-9.6 23.5s-17.3 6-25.3 1.7l-137-73.2L151 509.1c-8.1 4.3-17.9 3.7-25.3-1.7s-11.2-14.5-9.7-23.5l26.2-155.6L31.1 218.2c-6.5-6.4-8.7-15.9-5.9-24.5s10.3-14.9 19.3-16.3l153.2-22.6L266.3 13.5C270.4 5.2 278.7 0 287.9 0zm0 79L235.4 187.2c-3.5 7.1-10.2 12.1-18.1 13.3L99 217.9 184.9 303c5.5 5.5 8.1 13.3 6.8 21L171.4 443.7l105.2-56.2c7.1-3.8 15.6-3.8 22.6 0l105.2 56.2L384.2 324.1c-1.3-7.7 1.2-15.5 6.8-21l85.9-85.1L358.6 200.5c-7.8-1.2-14.6-6.1-18.1-13.3L287.9 79z"/></svg> Miembro - [LupusRGMX](https://twitter.com/LupusRgmx) - [Proyecto JAGUAR](https://twitter.com/PJaguarLATAM) - Viernes de Bioinformática ] .right-col[ <img src="imagenes/LAB-logo.png", height = "150"> <img src = "imagenes/lupus-logo.png"> <img src = "imagenes/jaguar-logo.png"> ] --- class: center, middle <svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 640 512" style="height:3em;width:3.75em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M392.8 1.2c-17-4.9-34.7 5-39.6 22l-128 448c-4.9 17 5 34.7 22 39.6s34.7-5 39.6-22l128-448c4.9-17-5-34.7-22-39.6zm80.6 120.1c-12.5 12.5-12.5 32.8 0 45.3L562.7 256l-89.4 89.4c-12.5 12.5-12.5 32.8 0 45.3s32.8 12.5 45.3 0l112-112c12.5-12.5 12.5-32.8 0-45.3l-112-112c-12.5-12.5-32.8-12.5-45.3 0zm-306.7 0c-12.5-12.5-32.8-12.5-45.3 0l-112 112c-12.5 12.5-12.5 32.8 0 45.3l112 112c12.5 12.5 32.8 12.5 45.3 0s12.5-32.8 0-45.3L77.3 256l89.4-89.4c12.5-12.5 12.5-32.8 0-45.3z"/></svg> # Clase 8. Generación de diversos gráficos usando ggplot2 --- # Qué es ggplot2? - Una biblioteca de visualización de datos para el lenguaje de programación R. - Permite a los usuarios construir gráficos complejos a partir de componentes simples y entendibles. - Ofrece amplias opciones para personalizar gráficos, incluyendo temas, leyendas y títulos. --- # [Anatomía de las gráficas de ggplot](https://www.geeksforgeeks.org/data-visualization-with-r-and-ggplot2/) <img src = "imagenes/anatomia.jpeg"> --- # [Anatomía de las gráficas de ggplot](https://www.geeksforgeeks.org/data-visualization-with-r-and-ggplot2/) - **Datos**: ggplot2 trabaja directamente con data frames en R, haciendo fácil la integración con otras herramientas de análisis de datos. - **Aes (Estéticas)**: Define cómo se mapean las variables de los datos a propiedades visuales como el color, forma y tamaño. - **Geoms (Objetos Geométricos)**: Representan tipos de gráficos como puntos, líneas, barras, etc. Permiten construir una amplia gama de visualizaciones. - **Facets**: permiten generar gráficos para múltiples subconjuntos de un conjunto de datos utilizando la misma escala y ejes, todo en una sola imagen - **Stats**: son funciones que resumen o transforman los datos de formas que facilitan su visualización --- # De un dataframe a una gráfica <img src = "imagenes/ggplot2_simplified.png", height = "500", width = "500"> .right-col[Source: [R for ecology](https://www.rforecology.com/post/a-simple-introduction-to-ggplot2/)] --- # Ideas de visualizaciones ### - [The data visualization catalogue](https://datavizcatalogue.com/#google_vignette) ### - [The R graph gallery](https://r-graph-gallery.com/) --- # Script para la clase de hoy Ir a [este link](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024/tree/main/Clase_ggplot/script_ggplot_clase.R)