El Plan de clases detallado con actividades, recursos, plantillas, material de lectura esta disponible en pdf. Aquí listamos la organización de los temas y las habilidades que el alumno debe lograr.
Introducción a la bioinformática
Comprender qué es Unix, sus características principales y su utilidad en entornos científicos y técnicos.
Conceptos Unix y GNU/Linux y protocolos de internet
Identificar los principales protocolos de intercambio de datos en internet y entender su funcionamiento básico.
Aplicar el protocolo de transferencia de archivos (FTP/SFTP) y acceder a servidores remotos de forma segura y eficiente.
Mis primeros pasos en Bash (archivos y permisos ) y creación de scripts completos
Comprender la estructura del sistema de archivos en Unix y saber desplazarse por él eficientemente.
Conocer y aplicar comandos básicos para gestionar archivos y directorios.
Identificar los tipos de archivos en Unix, visualizar su contenido y entender su manejo.
Utilizar herramientas para comprimir y descomprimir archivos.
Buenas prácticas en Bioinformática
Aplicar buenas prácticas en bioinformática para asegurar que los análisis sean reproducibles, claros y colaborativos, mediante código modular, documentación precisa y control de calidad.
Introducción a Markdown
Usar Markdown como formato estándar en bioinformática.
Comprender las fases del análisis de datos bioinformáticos.
Mis primeros pasos en Bash
Conocer los tipos de rutas, entorno de bash y Comandos básicos
Modificar permisos
Comprimir y descomprimir archivos
Análisis de datos de RNA-Seq
introducción a bioinformática
Idea principal de RNA-Seq
Pipeline general del análisis de datos de RNA-seq
Primeros pasos en el control de calidad de las lecturas
Wildcards y Streams
Caracteres y string
Wildcarts / comodines
Operadores de redirección de datos I/O
Expresiones regulates
Definición actualizada y didáctica del gen
¿Qué es un gen?
Potencial codificante y marco de lectura. abierto (ORF)
Tipos de archivos comunes en bioinformática
Herramientas clave en bioinformática
Pipeline de codificantes y no codificantes
Scripts en Bash