Curso de supervivencia: scRNA-seq + CITE-seq

Autores/as
Afiliaciones

Thais Crippa de Oliveira, Dra.

UNICAMP

Evelia Coss, Dra.

ENES, Juriquilla - UNAM

Fecha de publicación

2 de julio de 2026

Información general

Curso práctico multilingüe en línea

Enfoque en la resolución de problemas

  • Fecha: 2 de julio de 2026 (jueves)
  • Conversión de horario:

    • Ciudad de México, México

      • Zona horaria: GMT‑6
      • Hora: 10:00 AM

    • Brasilia, Brasil

      • Zona horaria: GMT‑3
      • Hora equivalente: 01:00 PM
  • Duración: 3 horas
  • Nivel: Intermedio
  • Regístrate para recibir las instrucciones previas al curso: Google form

Instructoras:

  • Dra. Thais Crippa de Oliveira - Investigadora posdoctoral en UNICAMP, Brasil
  • Dra. Evelia Lorena Coss-Navarrete - Profesora asociada en ENES, Juriquilla-UNAM, México. Página web

Ayudantes:

  • Juliana Pinto - Estudiante de doctorado, UFPA, Brasil
  • Adriana da Silva, PhD - Investigadora posdoctoral en UNIFESP, Brasil

🎯 Objetivo general

Permitir que los participantes naveguen en un conjunto de datos multimodal (RNA + ADT), realicen el preprocesamiento esencial e interpreten resultados básicos sin perderse en los detalles técnicos.

✅ Resultados esperados

  • Confianza para abrir y explorar datos multimodales.
  • Capacidad para ejecutar un pipeline básico en Seurat.
  • Comprensión de cómo los ADT complementan al RNA.
  • Conocimiento de las preguntas de investigación y limitaciones en CITE‑seq.

Citar y reutilizar el material del curso

Los datos del curso pueden reutilizarse y adaptarse libremente con la debida atribución. Todos los datos de estos repositorios están sujetos a la licencia Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0).

  • Verifica que todos los paquetes requeridos de R estén instalados, siguiendo las instrucciones proporcionadas en Get ready for the workshop.
  • Asegúrate de tener Git, R, RStudio y Bash correctamente instalados y funcionando en tu computadora.
  • Confirma que tienes acceso a una conexión a internet estable para la sincronización de repositorios y la descarga de paquetes.
Tema Duración Instructora
Repaso: Introducción a scRNA‑seq + CITE‑seq 30 min Evelia Coss
Configuración y uso de VirtualBox 20 min Thais Crippa
🎮 Kahoot Quiz: Introducción + Configuración 10 min Both
scRNA‑seq — Errores y supervivencia 50 min Thais Crippa
🎮 Kahoot Quiz: Fundamentos de scRNA‑seq 10 min Thais Crippa
CITE‑seq — Errores y supervivencia 50 min Evelia Coss
🎮 Kahoot Quiz: Fundamentos de CITE‑seq 10 min Evelia Coss