Curso de sobrevivencia: scRNA-seq + CITE-seq

Autores
Afiliações

Thais Crippa de Oliveira, Dra.

UNICAMP

Evelia Coss, Dra.

ENES, Juriquilla - UNAM

Data de Publicação

2 de julho de 2026

Informações gerais

CURSO PRÁTICO MULTILÍNGUE ONLINE

Foco na resolução de problemas

  • Data: 2 de julho de 2026 (quinta-feira)
  • Conversão de horário da reunião:
    • Cidade do México, México
      • Fuso horário: GMT‑6
      • Horário: 10:00 AM
    • Brasília, Brasil
      • Fuso horário: GMT‑3
      • Horário equivalente: 01:00 PM
  • Duração: 3 horas
  • Nível: Intermediário
  • Inscreva-se para receber as instruções prévias ao curso: Google form

Instructoras:

  • Dra. Thais Crippa de Oliveira - Pesquisadora de pós‑doutorado na UNICAMP, Brasil
  • Dra. Evelia Lorena Coss-Navarrete - Professora associada na ENES, Juriquilla-UNAM, México. Página web

Assistência:

  • Juliana Pinto - Estudante de doutorado na, UFPA, Brasil
  • Adriana da Silva, PhD - Pesquisadora de pós‑doutorado na UNIFESP, Brasil

🎯 Objetivo Geral

Permitir que os participantes naveguem em um conjunto de dados multimodal (RNA + ADT), realizem o pré‑processamento essencial e interpretem resultados básicos sem se perder nos detalhes técnicos.

✅ Resultados Esperados

  • Confiança para abrir e explorar dados multimodais.
  • Capacidade de executar um pipeline básico no Seurat.
  • Compreensão de como os ADT complementam o RNA.
  • Consciência das perguntas de pesquisa e limitações no CITE‑seq.

Citar e reutilizar o material do curso

Os dados do curso podem ser livremente reutilizados e adaptados com a devida atribuição. Todos os dados destes repositórios estão sujeitos à licença Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0).

  • Verifique se todos os pacotes necessários do R estão instalados, seguindo as instruções fornecidas em Get ready for the workshop.
  • Certifique‑se de que possui Git, R, RStudio e Bash corretamente instalados e funcionando em seu computador.
  • Confirme que você tem acesso a uma conexão de internet estável para sincronização de repositórios e download de pacotes.
Tópico Duração Instructora
Recapitulação rápida: Introdução ao scRNA‑seq + CITE‑seq 30 min Evelia Coss
Configuração e uso do VirtualBox 20 min Thais Crippa
🎮 Kahoot Quiz: Introdução + Configuração 10 min Both
scRNA‑seq — Erros e sobrevivência 50 min Thais Crippa
🎮 Kahoot Quiz: Fundamentos de scRNA‑seq 10 min Thais Crippa
CITE‑seq — Erros e sobrevivência 50 min Evelia Coss
🎮 Kahoot Quiz: Fundamentos de CITE‑seq 10 min Evelia Coss